1997年6月10日至13日，首列车在首期工程现状验交后，再次进入隧道，进行车辆调试计划中的200公里预验收试运行，逐步提速至80km/n。

　　中国建设银行广州市分行于1997年7月13日在广州市40个发售电公开发售广州地铁首套纪念卡，市民通宵达旦排队争购。至当天上午11时30分，70000套卡全部售罄。

 　 1997年11月1日，广州地铁一号线首期段转入试运行第一天，市民踊跃排队购票，全天按计划开出列车16对、32趟，载客5000多人次。

为庆祝首段开通一周年，地铁总公司在首期五站发售一套两枚的广州地铁纪念票（磁卡），共制作80000套。是总公司首次发行的磁性纪念票。

1999年2月16日起至3月2日，广州地铁一号线全线春节观光运行期结束，15天时间共开行列车2010次，安全载客139.2万人次。

1999年国庆节当天地铁一号线运送客流达37.3万人次，2日上升到39.3万人次，创开通以来的历史纪录。

2000年2月5日,农历除夕,广州地铁一号线运营时间延长到次日凌晨2:35,总运营时间20小时35分,安全运送乘客24.09万人次,创下广州地铁一号线开通运营以来日运营时间最长记录。

2000年五一黄金周七天假期间,广州地铁一号线安全运送乘客163万人次,其中5月1日、2日每天开车308列,每天服务时间达19小时。

2000年7月22日，地铁二号线从海珠广场向珠江南岸掘进的两台盾构机之一穗丰1#盾构机历尽艰辛,成功地在珠江南岸"登陆",比计划的工期"底线"，7月31日提前9天,是广州市的盾构法隧道首次从珠江底下穿过。

2000年10月1日，地铁单日客流的纪录在国庆节当日被刷新,达到39.3万人次；体育西路站国庆节当天创下7.2万人次的单个车站客流新纪录。

截止2001年1月18日，地铁一号线安全运营1300天。

2001年3月23-24日，国家计委委托省、市计委在广州主持召开"广州地铁一号线工程竣工验收大会"。一号线通过工程竣工验收。最终确定一号线全长为18.497公里，总投资122.616亿元人民币，比概算节省4.43亿元人民币，建设造价6.629亿元/正线公里，一号线17.78万平方米，工程建设为66个月。

2001年， 地铁二号线越秀公园-三元里盾构施工，在7月份左右线两台盾构共完成480米隧道掘进基础上，8月份左右线两台盾构单月进度双双超过300米。右线盾构日进度达22.5米，创造了土压平衡盾构施工进度的全国新纪录。

2001年9月26日，二号线纪念堂至越秀公园区间隧道贯通，该区间施工创造了国内水平冻结63.45米的新纪录。

2001年地铁二号线赤岗-鹭江盾构区间工程11月26日-12月25日左线掘进完成336米，右线掘进完成319.5米，两条隧道完成掘进量同时打破了今年3月创下的月进度318米的全国记录。

2002年1月8日，广州地铁二号线火车站土建工程胜利完工，比合同工期提前了21天。

2002年1月27日，广州地铁二号线越秀公园至三元里区间单机日掘进30米，1月份完成掘进405米，远远超过原全国城市地铁盾构施工日、月掘进纪录。

2002年7月23日，国家发展计划委员批准广州市轨道交通三号线可行性研究报告。该线路规划呈南北"Y"字形走向，全长35.86公里，全部为地下线。主线线路长28.43公里，设车站13座；支线线路长7.43公里，设车站5座。该工程估算总投资约为153亿元，平均造价4.3亿元/公里。

2003年6月,广州地铁三号线市番区间右线盾构机"木兰"二号创造日掘进及管片抨状24环（36米）的新记录，超过了广州地铁一、二号线盾构日进度20环（24米）和20环（30米）的记录。

2003年9月,广州市轨道交通三号线市桥站北至市桥站盾构区右线顺利贯通。该区间市三号线最长区间市桥站北－番禺广场区间德前段，全长1200米。

2003年11月8日,将两次穿越珠江的广州市轨道交通三号线【沥滘－大石】区间盾构隧道工程始发，这是三号线第9台盾构机进行掘进施工，地铁三号建设全面进入高潮。

2004年五一黄金周,广州地铁二号线开通运营的首个"五一"节，地铁运营创下两项纪录：单日双线客流总量82.6万人次，黄金周7天客运总量392万人次。

2004年5月,广州地铁三号线珠江新城-客村区间盾构右线顺利通过78米第一段珠江，是三号线工程首次通过珠江。

　　2004年7月,广州地铁三号线沥滘站-大石区间右线盾构机安全穿越了宽达312米的珠江三枝香水道。此次盾构穿越水道难度之大、速度之快实乃全国罕见。

2005年1月1－3日，一、二号线共运送乘客197.9万人次，日均65.97万人次，创开通以来元旦的最高纪录。

2005年2月9－15日，广州地铁一、二号线共计运送乘客383.4万人次，日均客运量达54.8万人次，创历年春节总客运量和日均客运量之最。

2005年4月，第97届广交会期间，广州地铁运送超过700万人次旅客，日均考核客运量达60.7万人次，较96届广交会期间增长13.3%。

2005年5月1－7日，一、二号线共运送乘客448万人次，日均64万人次，创开通以来"五一"的最高纪录。

2005年国庆假期期间地铁客流创历史新高，7天共运送乘客520万人次、日均客流74.3万人次，与去年同比增长25.4%。10月1日客流量更突破100万。

2005年10月，运营总部顺利完成第98届秋交会的客运组织工作，秋交会期间共运送乘客达1108.57万人次，创历次秋交会之最。

　　三号线最高时速达120公里，平均时速约60公里，为全球最快地铁列车。

广州地铁现有开通线路四条共54.12公里，运营日均客运量58.5万人次。

　　2005年一、二号线全年安全运送乘客21,354万人次，共运行3,1113万车公里，列车准点率达到99.93％。